חכם שלמה ואעקנין, נולד לאמו רחל ולאביו חכם מאיר ואעקנין בשנת תש"ד (1943), בעיר קזבלנקה שבמרוקו.
בילדותו, עלה עם הוריו לארץ ישראל, והתיישבו בעיר תל-אביב. אביו, היה מוהל ידוע, שבשבתות היה מסובב ברגל בכל העיר, לזכות במצוות המילה.
חכם שלמה ואעקנין גדל בעיר תל אביב, ובשנת תשכ"ב (1961) התגייס לצה"ל, ושירת בחטיבת גולני בתפקיד מפקד פלוגה. לאחר שחרורו עסק במלונאות, ושימש מנכ"ל מלון מלכת-שבא באילת.
בשנת תשל"ט (1979), נפטר אביו, וחכם שלמה ואעקנין עשה תשובה, והחל ללמוד בישיבת 'כף החיים' בירושלים מפי חכם יעקב חיים סופר. לאחר כמה שנים, החל ללמוד קבלה מפי זקן המקובלים, החכם יצחק כדורי, ומפי החכם המקובל שמואל דרזי. במהלך השנים, היה לתלמידו המובהק של החכם יצחק כדורי, ובערוב ימיו של החכם יצחק כדורי, היה יושב לצדו בזמן השיעור, ומוסר במקומו את תוכן השיעור.
בשנת תשנ"ג (1993), הקים את ישיבת המקובלים 'רחל אמנו' בירושלים, והיה נוהג לפקוד את קבר רחל אמנו דרך קבע. בישיבתו למדו אברכים ובעלי תשובה, ואת שיעוריו לימד בשפה פשוטה וברורה לכל נפש.
חכם שלמה ואעקנין נפטר ביום כ"א באייר תשע"ג (2013), ומנוחתו כבוד בהר המנוחות בירושלים.
הוא הותיר אחריו שבעה ילדים, ובתוכם, בנו ממשיך דרכו, חכם דוד ואעקנין. אין בידינו חיבורים שכתב, אבל ישנן הקלטות של שיעוריו בארכיון הישיבה. בין סדרות שיעוריו החשובים, שיעוריו על 'שערי קדושה לחכם חיים ויטאל, ו'ראשית חכמה' לחכם אליהו די וידאש.