חכם יעקב בירדוגו נולד לאמו ולאביו חכם יקותיאל בשנת תקמ"ו (1786) במקנס שבמרוקו.
חכם יעקב בירדוגו כונה 'אלחכם'. הוא שימש כראש אבות בתי הדין במקנס, ועמד בראש ישיבה בעיר.
חכם יעקב בירדוגו נפטר ביום כ"ט אב תר"א (1843) ונקבר במקנס.
חכם יעקב בירדוגו כתב את החיבורים 'תועפות רא"ם' - פירוש על חיבורו של רבי אליהו מזרחי; 'שבות יעקב' - דרושים; 'קדושת שבת' - פירוש למסכת שבת; 'גלי עמיקתא' - פירוש לספר 'מים עמוקים'; 'קול יעקב' - שירים; ו'שופריה דיעקב' - אוסף שאלות ותשובות