חכם אפרים לניאדו נולד לאביו חכם רפאל שלמה לניאדו ולאמו בחלב שבסוריה.
גדל בחכמה וביראה על ברכי אביו, חכם רפאל שלמה לניאדו, מחבר הספר 'בית דינו של שלמה', שבשנת תק"י (1749) נתמנה לראש אבות בתי הדין, וראש רבני ארם צובא.
חכם אפרים לניאדו נשא לאשה את קרובת משפחתו, בתו של חכם אליהו שלום.
בשנת תקמ"ז (1787) התמנה לתפקיד ראש אבות בתי הדין, וראש רבני ארם צובא, תחת אביו, שבשל גילו, מסר לו את התפקיד עוד בחייו. מינוי זה עורר תרעומת בקרב כמה מחכמי חלב, ובראשם החכם אליהו דוויך הכהן, שטיעוניו הובאו בספרו 'ברכת אליהו', שיצא לאור בשנת תקנ"ג (1792).
בשנת תקנ"ד (1793), נפטר אביו, ונטמן במערת הצדיקים, שליד בית כנסת הגדול, בחלב.
חכם אפרים לניאדו נפטר ביום כ"ח בשבט תקס"ה (1805), ומנוחתו כבוד בעירו חלב.
הוא הותיר אחריו כתבי יד רבים, מהם יצאו לאור לאחר מותו הספר 'דגל מחנה אפרים', בשנת תרס"ב (1902), בירושלים, בידי החכם שלום הדאיה. אחדות מתשובותיו פורסמו בחלק השלישי של הספר 'רועי ישראל', שיצא לאור בשנת תרס"ד (1904). וספרו 'הבן יקיר' - דרשות, יצא לאור בניו יורק בשנת תשע"ו (2016).
גדל בחכמה וביראה על ברכי אביו, חכם רפאל שלמה לניאדו, מחבר הספר 'בית דינו של שלמה', שבשנת תק"י (1749) נתמנה לראש אבות בתי הדין, וראש רבני ארם צובא.
חכם אפרים לניאדו נשא לאשה את קרובת משפחתו, בתו של חכם אליהו שלום.
בשנת תקמ"ז (1787) התמנה לתפקיד ראש אבות בתי הדין, וראש רבני ארם צובא, תחת אביו, שבשל גילו, מסר לו את התפקיד עוד בחייו. מינוי זה עורר תרעומת בקרב כמה מחכמי חלב, ובראשם החכם אליהו דוויך הכהן, שטיעוניו הובאו בספרו 'ברכת אליהו', שיצא לאור בשנת תקנ"ג (1792).
בשנת תקנ"ד (1793), נפטר אביו, ונטמן במערת הצדיקים, שליד בית כנסת הגדול, בחלב.
חכם אפרים לניאדו נפטר ביום כ"ח בשבט תקס"ה (1805), ומנוחתו כבוד בעירו חלב.
הוא הותיר אחריו כתבי יד רבים, מהם יצאו לאור לאחר מותו הספר 'דגל מחנה אפרים', בשנת תרס"ב (1902), בירושלים, בידי החכם שלום הדאיה. אחדות מתשובותיו פורסמו בחלק השלישי של הספר 'רועי ישראל', שיצא לאור בשנת תרס"ד (1904). וספרו 'הבן יקיר' - דרשות, יצא לאור בניו יורק בשנת תשע"ו (2016).