חכם חזקיה דוד אבולעפיה נולד לאמו ולאביו מרדכי אבולעפיה, נכדו של רבי חיים אבולעפיה הראשון, ממחדשי הישוב היהודי בטבריה.
אולי הוא מחבר הספר 'בן זקונים', שיצא לאור בשנת תקנ"ג (1793) בליוורנו. הספר כולל שני חלקים: 'יסוד עולם' - שישה פרקים בכללי התלמוד, ו'מזמור לדוד' - שירים, מליצות, וקינות.
חכם חזקיה דוד אבולעפיה נשא לאישה את בתו של רב העיר טריאסטי (היום בצפון מזרח איטליה) חכם יצחק פורמיג'וני אך מכיוון שלא נולדו להם בנים, לכן קרא לספרו 'בן זקונים'. כתבי יד נוספים שכתב 'שגיון לדוד' ו'קינת מנטובה' נשרפו ואינם.
חכם חזקיה דוד אבולעפיה נפטר ביום ז' בחשון שנת תקל"ג (1772), ואולי הוא זה שטמון ליד קבר זכריה למרגלות הר הזיתים בירושלים.
You who are Man's Guardian, grant our hands the strength that guards the paths of justice, instill in our hearts the ways of Your love and wholehearted awe of You, they will increase our valor. You, whose eyes see the entire world in a moment's glance, plant the seed of peace in the hearts of all residents of Khaled, that they may love one another and be devoted to each other as brothers, as good and loyal friends, and all be as one, that they may offer songs of love and gratitude to You for Your having bestowed Your majesty upon them.
Ben Zuqunim, Part Two, p. 75, Eliezer Saadon Publishing, Livorno 1793